Anavarin käyttö vähentää aivolisäkkeen luonnollista akselia, joka on tarpeen testosteronin tuotannon ylläpitämiseksi. Anavaria käyttävät miehet kokevat LH-, FSH-, SHBG- ja kokonais- ja vapaan testosteronin vähenemisen. Yleisemmin miehillä, joilla on krooninen lihasten häviäminen tai HIV-häviö, Anavar yhdistetään testosteronin kanssa.
Anavarin käytön on osoitettu vähentävän sukupuolihormonia sitovaa globuliinia (SHBG). SHBG:n väheneminen lisää vapaan testosteronin (aktiivisen) määrää kehossa.